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Riboswitchs : structure, mécanisme, classification et applications Learning biology and sharing books and courses

Les coronavirus (famille des Coronaviridae, genre Betacoronavirus) sont des virus à ARN simple brin de polarité positive, enveloppés, dont le génome est le plus grand parmi les virus à ARN (environ 26‑32 kb). Leur nom provient de l'aspect caractéristique de leurs spicules (glycoprotéines S) qui, observées au microscope électronique, évoquent une couronne solaire (corona en latin). Ces virus infectent un large éventail d'hôtes : mammifères (chauves‑souris, chameaux, humains) et oiseaux. Chez l'humain, les coronavirus endémiques (229E, OC43, NL63, HKU1) sont responsables de 10‑30 % des rhumes communs. Cependant, trois coronavirus émergents ont provoqué des épidémies sévères : le SARS‑CoV (2002‑2003), le MERS‑CoV (2012) et le SARS‑CoV‑2 (2019).

Propagation et detection de CoronaVirus (SARS) | BioEduc Idéalement, les patients atteints du SRAS devraient être soignés dans une salle d'isolement avec une pression négative par rapport à la zone environnante ou dans une chambre individuelle avec salle de bain et toilettes.

Complete NGS Guide: glossary, planning, depth calculation and assembly Learning biology and sharing books and courses

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Guide complet NGS : glossaire, planification, calcul de profondeur et assemblage | BIOEDUC
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🧬 NGS & Bioinformatique
Guide complet NGS : glossaire, planification, calcul de profondeur et assemblage

1. Introduction au flux de travail NGS
Le séquençage nouvelle génération (NGS) a révolutionné la recherche biologique en permettant une analyse génomique à haut débit à une échelle et un coût sans précédent. Cependant, la transition d'échantillons biologiques à des données génomiques de haute qualité nécessite une maîtrise des termes bioinformatiques, des contrôles de qualité et une conception expérimentale précise. Une solide compréhension du glossaire NGS et des calculs de profondeur de séquençage est essentielle pour éviter les sous‑séquençages, les variants manquants ou les gaspillages de capacité de flow cell. Ce guide vous accompagne à travers l'ensemble du flux de travail NGS – des lectures brutes à l'assemblage et à l'annotation – en fournissant des calculs pratiques étape par étape

Guide complet NGS : glossaire, planification, calcul de profondeur et assemblage | BIOEDUC Le séquençage nouvelle génération (NGS) a révolutionné la recherche biologique en permettant une analyse génomique à haut débit à une échelle

Les avancées technologiques en séquençage à haut débit (NGS) ont révolutionné notre compréhension des génomes. Longtemps occultés par la simplicité d’analyse des polymorphismes nucléotidiques uniques (SNP), les variants structuraux (SVs) émergent aujourd’hui comme des acteurs clés de la diversité génétique, de l’évolution et des pathologies complexes. Par convention, un variant structural est défini comme une altération génomique affectant un segment d’ADN d’au moins 50 paires de bases (pb). Contrairement aux SNPs ou aux petites indels, les SVs modifient profondément l’architecture du génome. Ils interviennent dans les maladies humaines (cancers, maladies neurodéveloppementales), l’évolution (duplications de gènes) et l’adaptation des organismes non‑modèles.

Genome assembly Learning biology and sharing books and courses

Les avancées technologiques en séquençage à haut débit (NGS) ont révolutionné notre compréhension des génomes. Longtemps occultés par la simplicité d’analyse des polymorphismes nucléotidiques uniques (SNP), les variants structuraux (SVs) émergent aujourd’hui comme des acteurs clés de la diversité génétique, de l’évolution et des pathologies complexes. Par convention, un variant structural est défini comme une altération génomique affectant un segment d’ADN d’au moins 50 paires de bases (pb). Contrairement aux SNPs ou aux petites indels, les SVs modifient profondément l’architecture du génome. Ils interviennent dans les maladies humaines (cancers, maladies neurodéveloppementales), l’évolution (duplications de gènes) et l’adaptation des organismes non‑modèles.

Détection des variants structuraux en génomique Les avancées technologiques en séquençage à haut débit (NGS) ont révolutionné notre compréhension des génomes.

Séquençage de Sanger : principes, workflow, applications et limites | BIOEDUC
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Molecular Biology
🧬 Génomique & Séquençage
Séquençage de Sanger : principes, workflow, applications et limites

Le séquençage de l'ADN a révolutionné la science moderne, transformant notre compréhension de la génétique, de la médecine et de la biologie évolutive. Au cœur de cette révolution génomique se trouve une technologie fondamentale qui a résisté à l'épreuve du temps : le séquençage de Sanger. Développée à la fin des années 1970, cette technique de référence reste un atout essentiel dans les laboratoires modernes du monde entier. Que vous soyez un étudiant apprenant les bases de la biologie moléculaire, un chercheur validant un plasmide cloné, ou un bioinformaticien analysant des séquences, il est crucial de comprendre les mécanismes de cette méthode de séquençage de l'ADN classique.

Séquençage de Sanger : principes, workflow, applications et limites | BIOEDUC Au cœur de cette révolution génomique se trouve une technologie fondamentale qui a résisté à l'épreuve du temps : le séquençage de Sanger

Analyse comparative des principales plateformes de séquençage ADN (NGS )

Vue d’ensemble du séquençage nouvelle génération (NGS)
Le séquençage nouvelle génération (NGS) regroupe les technologies à haut débit permettant le séquençage massif et parallèle des acides nucléiques. Par rapport au séquençage Sanger, le NGS offre un débit considérable, un coût par base réduit et des délais d’exécution courts. Les plateformes NGS se répartissent en deux grandes catégories : le séquençage à lectures courtes (Illumina) et le séquençage à lectures longues (PacBio, Oxford Nanopore). Parmi ces dernières, la technologie Oxford Nanopore se distingue par sa capacité à mesurer directement les molécules d’ADN ou d’ARN sans amplification ni synthèse, en temps réel, avec des lectures pouvant dépasser le mégabase.

2. Principe du séquençage Oxford Nanopore
La technologie Oxford Nanopore repose sur la mesure des variations de courant ionique lorsqu’un acide nucléique traverse un nanoscale pore protéique.

Un nanopore biologique (généralement issu de la bactérie E. coli ou modifié) est inséré dans une membrane synthétique.
Une différence de potentiel électrique est appliquée, créant un courant d’ions à travers le pore.
Lorsqu’une molécule d’ADN ou d’ARN passe par le pore, chaque nucléotide perturbe le courant de façon caractéristique.
Ces perturbations sont enregistrées en temps réel et converties en séquence par des algorithmes d’appel de bases (basecalling).
🔬 Atouts clés : lectures ultra‑longues (jusqu’à >1 Mb), analyse en temps réel, séquençage direct de l’ARN, détection native des modifications épigénétiques (méthylation), et portabilité grâce à des dispositifs comme le MinION.

https://www.bioeduc.com/2026/06/sequencage-oxford-nanopore-principes.html?m=1